初めは駿河国の今川氏に仕え、永禄3年(1560年)の桶狭間の戦いにおいて兄の元宗が戦死したため家督を継ぎ、遠江国久野城主となる。永禄11年(1568年)に三河国の徳川氏に久野城を攻められると、徳川家康の家臣･高力清長の説得によって降伏した。だが、叔父ら久野一族は主君･今川氏真への忠義から家康謀殺を計画するものの宗能が肯ぜずに内紛となるが、家康の救援で鎮圧した。その後、甲斐国の武田信玄の西上作戦でも久野城を包囲されるが、城を堅守した。
　その後も高天神城攻めなどで功績をあげ、天正18年(1590年)に徳川家康が関東地方に移封になると、下総佐倉で1万3千石を与えられるが、間もなく嫡子の宗朝に家督を譲った(ただし、佐倉藩の領主変遷に関しては諸説ある)。ところが、慶長元年(1596年)になって宗朝が私闘の末に自害すると改易処分を受け、宗能には別に1,000石を与えられる。関ヶ原の戦い後に改めて旧領の遠江久野に戻されて8千500石を与えられた。慶長14年(1609年)に83歳で死去。家督は孫の久野宗成(宗朝の子)が継承したが、後に紀州藩の御附家老になっている。

　紀州藩田丸城代家老久野家初代当主。官位は従五位下丹波守。慶長元年(1596年)父･宗朝が徳川秀忠上洛の供をした際、遺恨により三宅弥次兵衛を殺害し自害したため改易となり、本多忠勝に養われる。
　慶長5年(1600年)関ヶ原の戦いに出陣し、退却する島津勢を本多忠朝と共に追撃し戦功を挙げる。慶長14年(1609年)祖父･宗能の死去により家督相続し、遠江久野城主となる。慶長16年(1611年)従五位下丹波守に任官。同年、主君徳川家康の10男の駿河駿府城主･徳川頼宣付き家臣となる。
　慶長19年(1614年)の大坂冬の陣、慶長20年(1615年)大坂夏の陣に出陣。元和5年(1619年)頼宣が紀州に転封となると、1万石を与えられ、熊野地域の押えとして田丸城代となる。