永正年間(1504～21年)頃、この地方の国人･浜名氏とともに今川氏に属していた後藤氏によって築かれたとされる。1560(永禄3)年、今川義元に従軍した当時の当主･後藤九郎真泰は桶狭間の戦いで討死してしまう。義元敗死以後、分家の後藤実久は徳川家康に付くが、城主の後藤直正は佐久城の浜名氏とともに(直正の妻は浜名頼広の妹)家康に抵抗し、1569(永禄12)年2月、家康の遠州侵攻の際に徳川方の戸田忠次に攻められ落城、敗者となった直正は家康の陣所前で下馬しなかったことを咎められ、山岡半七という者に鉄砲で撃たれてしまった。そして、日比沢城は分家の後藤実久に与えられた。1590(天正18)年、家康の関東入りとともに廃城になったとされる。
　城跡は東西に並ぶ3つあるいは2つの郭から成り、東側が主郭とされる。西側の郭は宅地,みかん畑となっている。主郭の北側と西側に堀跡がみられ、内部西側に土塁、また北側に井戸跡が残されている。