相国寺境内のこの地には、もともと1653(承応2)年に後水尾上皇によって再建された三重大塔があり、上皇の落飾時の髪と歯をその上層部の柱心に納めていた。しかし、大塔は1788(天明8)年の天明の大火で焼失してしまったため、その後、大塔跡に髪歯塚が造られた。
　なお、後水尾上皇は1680(延宝8)年8月19日、85歳で崩御し、泉涌寺内の後水尾天皇陵に葬られている。