1782(天明2)年4月、尾張藩が美濃国中部･東部の直轄領支配のために設置した代官所である。同年、鳴海代官所，小牧代官所，鵜多須代官所，円城寺代官所が、また前年には佐屋代官所，北方代官所，水野代官所が設置された。
　太田宿には中山道三大難所の一つである｢太田の渡し｣があり、飛騨街道や郡上街道の分岐点で交通の要衝であるため、美濃国の中部と東部の直轄領の蔵入地･給地を支配･管轄するのが目的であった。
　初代代官は井田忠右衛門が務めている。1790～92(寛政2～4)年の太田代官所下役人構成及び人員は、代官(石高75俵)，手代4名，手代並2名，足軽3名，小使12名であった。1794(寛政6)年には領内管理担当の国奉行と財務担当の勘定奉行を統合して、地方勘定奉行として機構の簡素化を図った。
　1868(慶応4)年には北地総管所と改名され、田宮如雲が総管に任命された。このとき坪内逍遙の父である平右衛門信之が役人(手代)として勤めており、逍遥がその様子を書き残している。代官所近くに坪内逍遥の生誕地がある。