水田遺構を伴う弥生時代後期の1世紀頃の集落遺跡，低湿地遺跡である。太平洋戦争中の1943(昭和18)年7月10日、軍事工場建設の際に発見された。戦後の1947(昭和22)年、考古学･人類学･地質学など各分野の学者が加わった日本で初めての総合的な発掘調査が行われ、8万㎡を超える水田跡や井戸の跡、竪穴状平地建物，高床倉庫の遺構が検出された。この他にも、農耕や狩猟，漁労のための木製道具や火起こしの道具、占いに用いた卜骨なども出土している。なお、竪穴状平地建物とは、竪穴建物と異なり、床面を地表より低く掘り下げず、盛土(周堤)で土壁を構築する平地建物。これは、この地が特に地下水位が高く、地面を掘ると水が湧き出す土地であったためと考えられている。
　さらに、1999(平成11)年から5ヶ年計画で再発掘調査が行われ、新たに銅釧や漆が塗られた槽づくりの琴が出土し、祭殿と見られる大型の掘立柱建物跡などが検出された。また、それまで大区画水田と思われていた水田跡の中に小畦畔があることが確認され、小区画水田であることが判ってきた。
　登呂の弥生集落は、安倍川の洪水により押し流された土砂が堆積して形成された自然堤防上に造られている。集落には、北東から南西の方向に広がる微高地を利用して竪穴状平地建物12棟，高床倉庫2棟が建っており、水田はその南につくられている。
　現在、遺跡は｢登呂公園｣として整備され、各種建物などが復元されているほか、静岡市立登呂博物館が隣接して建てられている。