築城年代は定かではないが、小野義教が当地に住んで大井兵庫頭と名乗り居城としたとされる。浅井氏が台頭してくると、大井氏は美濃国北方へ逃れて小野姓に復した。
　その後、浅井氏の家臣で地侍の鈴木三右衛門が城主となったが、織田信長の近江侵攻によって落城した。江戸時代には高橋源左衛門が居住したという。
　大井城は小字｢竹之鼻｣の辺りに築かれており、この場所には｢三右衛門屋敷｣,｢三右衛門淵｣の名が残る。