創建時期は定かではないが、前芝村(現在の豊橋市)に東漸寺という真言宗の寺が存在した。しかし、やがて廃寺となり、延命地蔵尊を祀る小堂だけが残されていたという。ところが、津波によりこの地蔵尊が伊奈の地に流れ着き、村人たちはこれを崇めて祀っていた。
　1492(明応元)年、第3代伊奈城主･本多正時(泰次)がこの地蔵尊を本尊として堂宇を建て、知多郡緒川の乾坤院の亨隠慶泉禅師を開山とし、萬年山東漸寺と名付け、本多家先祖累代の菩提寺とした。現在の本堂の建築費も本多家の篤志と伝えられている。