築城年代,築城者はは定かではない。初期の城主には清原右馬允,内藤十郎市の名がある。戦国時代には、亀山城主の作手奥平貞久の四男主馬允が萩を分与され、萩奥平氏の祖となった。その後、伝五郎,周防守勝次と続き、奥平勝次は1575(天正3)年の長篠の戦いで宗家の奥平信昌と共に長篠城に籠城し戦功を挙げている。7代正俊で断絶となった。
　萩城は標高149ｍ,比高30ｍの丘陵先端頂部に築かれ、現在は曲輪,堀,土塁,井戸跡が残る。主郭は最高部にあり東西に長く大きな削平地で、西端に土塁を設けている。南側には虎口があり、北隣りに井戸跡が確認できる。